Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh1a2Q62148 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms