Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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PtprrQ62132 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PtprrQ62132 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PtprrQ62132 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PtprrQ62132 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PtprrQ62132 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PtprrQ62132 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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PtprrQ62132 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprrQ62132 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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