Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtafrQ62035 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtafrQ62035 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtafrQ62035 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtafrQ62035 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtafrQ62035 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PtafrQ62035 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PtafrQ62035 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PtafrQ62035 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PtafrQ62035 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PtafrQ62035 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtafrQ62035 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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