Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ifi47Q61635 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ifi47Q61635 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ifi47Q61635 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ifi47Q61635 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ifi47Q61635 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifi47Q61635 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms