Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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DbpQ60925 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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DbpQ60925 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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DbpQ60925 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DbpQ60925 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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DbpQ60925 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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DbpQ60925 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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DbpQ60925 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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DbpQ60925 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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DbpQ60925 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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DbpQ60925 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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DbpQ60925 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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DbpQ60925 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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DbpQ60925 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DbpQ60925 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DbpQ60925 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms