Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurod1Q60867 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms