Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RelnQ60841 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RelnQ60841 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RelnQ60841 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RelnQ60841 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RelnQ60841 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RelnQ60841 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RelnQ60841 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RelnQ60841 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RelnQ60841 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RelnQ60841 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms