Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3Q60803 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms