Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd4Q60688 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms