Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp13a3Q5XF89 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms