Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vps54Q5SPW0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms