Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms