Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ecm2Q5FW85 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms