Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WhammQ571B6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms