Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdp2Q504M2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms