Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL04

Gm5168, Predicted gene 5168, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5168Q4KL04 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm5168Q4KL04 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm5168Q4KL04 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm5168Q4KL04 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm5168Q4KL04 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm5168Q4KL04 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm5168Q4KL04 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm5168Q4KL04 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm5168Q4KL04 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm5168Q4KL04 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm5168Q4KL04 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5168Q4KL04 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms