Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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