Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms