Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms