Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
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Usp48Q3V0C5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Usp48Q3V0C5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Usp48Q3V0C5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Usp48Q3V0C5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Usp48Q3V0C5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Usp48Q3V0C5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp48Q3V0C5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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