Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk4Q3V016 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms