Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Pfdn4Q3UWL8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Pfdn4Q3UWL8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Pfdn4Q3UWL8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Pfdn4Q3UWL8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Pfdn4Q3UWL8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Pfdn4Q3UWL8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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