Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms