Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms