Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc33Q3ULW6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms