Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CrxosQ3UL53 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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