Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc34Q3UI66 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms