Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms