Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serac1Q3U213 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms