Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc174Q3U155 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms