Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gdpd4Q3TT99 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gdpd4Q3TT99 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gdpd4Q3TT99 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gdpd4Q3TT99 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gdpd4Q3TT99 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gdpd4Q3TT99 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gdpd4Q3TT99 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gdpd4Q3TT99 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd4Q3TT99 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms