Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms