Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdlim7Q3TJD7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms