Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-M3Q31093 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms