Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms