Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim71Q1PSW8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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