Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Fam171bQ14CH0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Fam171bQ14CH0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Fam171bQ14CH0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Fam171bQ14CH0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms