Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms