Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms