Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms