Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdx4Q07424 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms