Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms