Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms