Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnb1Q03717 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnb1Q03717 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms