Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms