Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Crisp3Q03402 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms