Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms