Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ascl1Q02067 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms