Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms