Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms